Inden for biologi er dens egen nomenklatur blevet udviklet for at beskrive en bestemt organisme, som hører til dyre-, svampe- eller planteriget. Det afspejler tilhørsforhold til en art, afhængigt af karakteristikaene for morfologi og udseende. For dyr anvendes kriterierne for at henvise til en art, afhængig af evnen til at producere frugtbart afkom under befrugtningen. Disse mønstre gælder dog kun for disse organismer, mens mikrober ikke kan klassificeres på denne måde.
Begrebet stamme i mikrobiologi
På grund af tilstedeværelsen af et stort antal organismer, der har morfologiske egenskaber, men forskellige biokemiske og immunologiske egenskaber, er det umuligt at anvende standardnomenklatur til navngivning. Som et resultat blev et sådant koncept som en stamme introduceret. Dette er en ren kultur af mikrober, der er blevet isoleret og isoleret et bestemt sted på et bestemt tidspunkt.
Hver mikrobe, der tilhører en stamme, ligner en anden sådan repræsentant med hensyn til biokemiske, morfologiske, immunologiske og genetiske kriterier. Men inden for den samme bakterieart observeres en sådan analogi ikke. Derfor er en stamme et mere fleksibelt navn for en mikrobiel kultur. Fordi hurtigtudvekslingen af genetisk materiale (mutation) fører til fremkomsten af nye organismer inden for en art, men med forskellige egenskaber er det denne definition, der giver os mulighed for mere præcist at karakterisere patogenicitet og virulensfaktorer.
Bakteriestammer
Den eksisterende nomenklatur af bakterier gør det muligt at klassificere typer af organismer, men karakteriserer ikke deres nye egenskaber. Sidstnævnte dukker op som et resultat af hurtig mutation og erhverver nye egenskaber, herunder dem, der er patogene for mennesker, husdyr og planter, såvel som andre mikrober. Et eksempel på nomenklatur, der bruger eksemplet med Escherichia coli, ser sådan ud: kongerige - bakterier, type - Proteobakterier, klasse af gamma-proteobakterier, orden - Enterobacteriales, Enterobakteriefamilie. Slægten er Escherichia og arten er Escherichia colli. Der er dog mange kulturer af bakterier af arten Escherichia colli, der viser forskellige egenskaber. De er isoleret i separate bakteriestammer og har et ekstra navn. For eksempel Escherichia colli O157:H7.
E. coli selv er til stede i den menneskelige tarm og forårsager ikke sygdom, men O157:H7-stammen er udelukkende patogen på grund af tilstedeværelsen af et stort antal virulensfaktorer. Hun har oplevet en epidemi af enterotoksige sygdomme i de sidste 5 år.
Virusstammer
Begrebet en stamme er et fleksibelt navn for organismer med de samme egenskaber, som blev isoleret og derefter identificeret og beskrevet i et bestemt område på et bestemt tidspunkt. Med sit forløb kan virussen erhverve nye egenskaber på grund af antigenafdrift. Dette vil skabe en ny viral stamme, muligvis mere patogen end sin forælder.
Du kan tydeligt vise fremkomsten af nye stammer ved at bruge eksemplet med influenzavirus. Det tilhører familien af Orthomyxovirus og er navngivet afhængigt af antigenerne (hæmagglutininer og neuraminidase) HxNy. X og Y er numeriske værdier, der afspejler tilstedeværelsen af antigener. Et eksempel er H5N1, kendt for den nylige svineinfluenzaepidemi med hurtigt fremadskridende hæmoragiske lungebetændelser. Ifølge teorien kan en ny og mere farlig stamme udvikle sig fra denne stamme på grund af den samme antigene drift.
Svampestammer og protiststammer
Skimmelsvampe er den mindst variable af alle mikrober, selvom deres biokemi også er kompleks. På grund af en mere kompleks struktur end bakterier og vira, og også på grund af manglen på mekanismer til hurtig genoverførsel, stiger antallet af nye svampestammer en smule. Der er også en opfattelse af, at enhver nyopdaget svampestamme er en allerede eksisterende organisme, som simpelthen ikke er stødt på forskerne.
En lignende situation eksisterer i protisternes rige. Deres evne til at mutere er lav, så sandsynligheden for, at nye stammer opstår hurtigt, er ekstremt lille. Der opstår dog stadig nye varianter af organismer af samme art. Derfor har de tilsyneladende også eksisteret tidligere, men blev ikke opdaget.
