Deoxyribose er et 5-carbon monosaccharid (pentose), der dannes ud fra ribose, når det mister et oxygenatom. Den empiriske kemiske formel for deoxyribose er C5H10O4, og på grund af tab af en oxygenatom, stemmer det ikke overens med den generelle formel for monosaccharider (CH2O) , hvor n er et heltal.
Fysiske og kemiske egenskaber
Den lineære formel for deoxyribose kan repræsenteres som følger: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Det eksisterer dog også i form af en lukket ring af carbonatomer.
Deoxyribose er et farveløst fast stof, der er lugtfrit og meget opløseligt i vand. Dens molekylvægt er 134,13 g/mol, smeltepunkt 91 °C. Det opnås fra ribose-5-phosphat på grund af virkningen af passende enzymer under den kemiske reduktionsreaktion.
Forskellen mellem ribose og deoxyribose
Som allerede nævnt, og som navnet antyder, er deoxyribose en kemisk forbindelse, hvis atomsammensætning adskiller sig fra riboses med kun et oxygenatom. Som visti figuren nedenfor har deoxyribose ikke en OH-hydroxylgruppe på sit andet carbonatom.
Deoxyribose er en del af DNA-kæden (deoxyribonukleinsyre), mens ribose er en del af RNA-kæden (ribonukleinsyre).
Det er interessant at bemærke, at monosacchariderne arabinose og ribose er stereoisomerer, det vil sige, at de adskiller sig i rumligt arrangement i forhold til planet af OH-grupperingen nær det 2. carbonatom. Deoxyarabinose og deoxyribose er den samme forbindelse, men det andet navn bruges, fordi dette molekyle er afledt af ribose.
Deoxyribose og genetisk information
Fordi deoxyribose er en del af DNA-kæden, spiller det en vigtig biologisk rolle. DNA - kilden til genetisk information, består af nukleotider, som omfatter deoxyribose. Deoxyribosemolekyler forbinder et nukleotid til et andet i DNA-kæden gennem fosfatgrupper.
Fraværet af hydroxyl-OH-gruppen i deoxyribose har vist sig at give mekanisk fleksibilitet til hele DNA-kæden sammenlignet med RNA, hvilket igen gør det muligt for DNA-molekylet at danne en dobbeltstreng og være i en kompakt form inde i cellekerne.
På grund af fleksibiliteten af bindinger mellem nukleotider dannet af deoxyribose-molekyler og fosfatgrupper er DNA-kæden desuden meget længere end RNA. Dette faktum gør det muligt at kode genetisk information med høj tæthed.
